细胞类型特有的eQTL是复杂特征遗传结构的基础

细胞类型特有的eQTL是复杂特征遗传结构的基础。

摘要

对复杂特征的遗传效应主要通过调节基因表达来发挥作用；然而，这一过程并没有被很好的理解 1. 对基因表达的遗传效应（表达定量特征(eQTLs))的研究可以了解基因变体与复杂特征2之间的基因调控层。 然而，之前的研究并没有有效地捕捉到细胞型特异性的eQTL,这对复杂的特质可能很重要。 在这里，我们通过在人口规模单细胞RNA-序列(RNA-seq)数据中应用差异成分模型，对细胞类型特定eQTL进行无偏见的定性。 我们利用来自OneK1K组群的外围血单核细胞，证明了细胞型特异性eQTL为复杂的特异性而丰富了，对于细胞型共享eQTL我们没有观察到这一点。 我们还发现，eQTL的特异性与具有更大选择性约束、增强力复杂性和基因网络连通性的基因相关，相对于已知的eQTL 3, 4, 复杂特征丰富了三个特异性。 Transscription-wide, transfer eQTL 大多是细胞类型特异性(60%特异性）,而cis eQTL 大多是共享的(30%特异性）. 我们使用第二个单细胞RNA-seq数据集来复制我们的发现，并证明细胞型共享和细胞型特异的eQTL在各蚁群之间是一致的。 我们的成果将eQTL细胞类型的特异性确定为基因调控的一个关键特征，并部分解释了已知的eQTL为何在基因调控对复杂特征的影响上被耗尽。

主要

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（编译自 Nature；原文 https://www.nature.com/articles/s41586-026-10577-6，编译转述，非原文转载）